瘟疫传说是无辜的。为什么要逮捕雨果？

瘟疫传说的核心线索是逐渐揭开两兄妹踏上逃亡之旅的真正原因。

按照游戏开头描述的情节，女主角阿米西亚的家庭突然遭遇灭顶之灾。在宗教裁判所的屠杀下，只有阿米西亚和雨果从敌人手中逃脱。随着游戏进行到下半场，背后的主谋维塔利斯法官透露了整个事件的真相:他们已经得知雨果是继承马库拉血统的人，法官希望在某个时间点之前得到雨果的血液，这样他也可以获得控制老鼠的能力。

至于为什么要获得这种能力，在一次首席大法官和大主教的对话中，维塔利斯是这样说的:诡计，大主教的诡计能改变世界吗？为了让这种能力完全在自己的控制之下，审判所研制出了一只不受雨果控制的小白鼠，导致了最后的黑白鼠之战。最后在阿米西亚的帮助下，大法官的白老鼠败给了雨果的黑老鼠，大法官统治世界的野心破灭了。与此同时，三天后瘟疫消失，两兄妹即将踏上新的旅程。