问GBA的口袋妖怪也是同样顺序玩，故事也有点强迫症。
标题游戏分类首次发布时间
神奇宝贝红宝石版主系列RPG 2002
神奇宝贝弹球桌红宝石蓝宝石弹球桌系列2003
神奇宝贝火红叶绿版主系列RPG 2004
神奇宝贝翡翠版主系列RPG 2004
神奇宝贝的不可思议的迷宫红色救援迷宫系列2005
神奇宝贝红宝石版(日文:ポケットモンスタールビーーーーーーーーーーーー125和之前的版本一样，冒险地点选在了一个全新的区域，一个富人区。初学神奇宝贝也和以前不一样了。
和金银版一样，本作新增了135种神奇宝贝，将国民绘本扩充至386种。但是，这两个版本无法与上一个版本通信以获得上一个版本的神奇宝贝。
这款游戏中加入了神奇宝贝华丽竞技，玩家可以用神奇宝贝与他人在外貌上进行竞技。而战斗塔则是从水晶版保留下来的。
从京城搬来的主人公首先来到丰原的白微镇，开始了他/她的旅程。主角的父亲是李倩桔子中国道场的一名道场教练。刚进屋，就能看到很多豪力在帮忙搬东西。设定好时钟后，主角的妈妈会让主角在电视机前看他爸爸的采访。在主角匆匆走向电视前，采访结束了。于是主角的母亲建议主角去拜访他父亲的朋友:奥德胡安博士。
到达了奥德胡安博士的家，他的妻子和孩子(如果玩家选择了May，那就是Nobuki如果玩家选择信行，在家的是梅，而尾田胡安博士不在家。参观结束后，主角走到Road 101，发现奥德胡安博士正被一只郊狼追赶。他让主角从木须公、火稚鸡和背包里剩下的跳跳鱼中选一只神奇宝贝来打退德国牧羊犬。之后，为了感谢主角救了他，小田娟会把主角选的神奇宝贝赠送给主角。然后他告诉主角去103路学习如何成为一名驯兽师。
刚来103路的时候，主角就要对敌了。之后，回到奥德博士的研究所，主角将接待神奇宝贝球。离开研究所后，主角的妈妈还会给主角风速鞋。
当主角第一次到达华晨市时，李倩非常高兴他的孩子已经成长为一名培训师。这时，一个名叫小光的孩子来找李倩，要求他教自己抓神奇宝贝。特里尼达给了他一个蛇纹熊和一个神奇宝贝球，并要求主角陪伴他。在102路上，他俘虏了一个拉鲁拉西，然后他们回到了道场。千里要求主角前往丰原，收集八枚徽章。道观的主人是杜娟、藤树、铁铉、亚莎、李倩、娜琪、冯楠和米粒力。
主角随后来到104号公路，穿过橘林。在森林的出口处，主角遇到了火岩队R或水舰队s的成员，战后，那个玩家解释了一些关于他的组织的事情。
在卡纳兹道场，主角与主人杜娟对战，获得了岩石徽章。后来主角遇到了文德制造有限公司的总裁，他说他被火岩队R/水舰队S抢劫了，希望主角能帮他拿回东西。主角追着敌对组织追到公路116，找到了一个叫哈奇的老人，他的长翅鸥也被敌对组织抢走了。愤怒的主角冲进卡卢隧道，与对方展开激战，取得胜利，拿回东西和长翼鸥。
玩家在兑换了Devin制造有限公司总裁的商品后，可以获得一个神奇宝贝试播集和Zvochi总裁的一封信，需要交给大吴。主角返回道路104，乘坐老人哈奇的船经过水路105和水路106到达五斗镇。主角得知子不语大武在石头的山洞里，于是急忙赶到山洞。在入口处，主角收到了一个秘密技能学习者05(闪光)，但在击败武斗道场之前不能使用。在轻松击败道场训练师藤树赢得拳击徽章后，主角来到石头洞穴，打开闪光灯，在黑暗的洞穴内轻松行走，最终找到了大吴。大吴收到信后，交给主角的技能学习者47(钢铁之翼)表示感谢，然后告诉主角，他们可能会在《神奇宝贝联盟》中再次相遇。
离开五斗镇后，老哈奇带着主角穿越水路107、水路108、水路109，来到了凯纳城。主角下船后，发现火岩队的R/ S队员堵住了海洋科学馆的入口。当主角来到Koesno Ji造船厂时，他在海洋博物馆找到了馆长Koesno Ji。当主角找到馆长Koesno Ji时，他被两个敌对组织的成员包围。在主角打败他们之后，赤焰松R或者阿奇S就会出现，告诉主角他们的目标，警告主角不要再影响他们了。
Pokemon Pinball Ruby Sapphire(日文:ポケモンピンボールルビー & サファィァ，英文:poké mon pinball: ruby & Sapphire)是对应第三代游戏的poké mon pinball游戏。这部作品是时隔四年之后的弹球桌作品。与前作不同的是，神奇宝贝扩展到了第三代水平，画面变得丰富多彩，模式也更多了。
神奇宝贝红色版(日文:ポケットモンスターファィァレッド)这是红色和绿色版的翻拍。
神奇宝贝翡翠版(日语:ポケットモンスターェメラド，英语:神奇宝贝翡翠版)
2005年，它是北美销量第二高的电子游戏。它也是Game Boy Advance中第三畅销的游戏，仅次于红宝石和蓝宝石版本以及火焰、红色和绿色版本。翡翠是Game Boy系列的最后一款主打系列游戏。
与红宝石和蓝宝石版本不同。
在原版中，豪力帮助玩家移动的情节被改为极度活跃的猿类帮助玩家移动。
道场迷宫的重新设计。
冠军房间的颜色从紫色变成了蓝色。
主线变化
火岩队和水舰队都成了敌对组织。
游戏变化
古拉多和盖欧卡的捕获地点改变了，它们的等级也提高了。
将之前的战斗塔扩展成新的战斗发展区。
新增了肚脐岩、生辰岛、边陲岛三个与绿版火红叶一致的地点。这三个地点都是用来捕捉传说中的神奇宝贝的。
字符变化
换了阿美和大冢的衣服。
把神奇宝贝联盟的冠军从大武换成了水系道场的前训练师米克利，把水系道场的训练师换成了米克利的老师亚当。
前神奇宝贝联盟冠军大武在主角成为新冠军后出现在流星瀑布深处。主角可以挑战一次。
神奇宝贝神秘救援队(日文:ポケモンダンジョンの救援队，英文:神奇宝贝神秘地牢:红色救援队)英文:神奇宝贝神秘地牢:蓝色救援队是一款同时在NDS和GBA上发布的RPG游戏，也是第一款神奇宝贝不可思议迷宫系列游戏。2005年，165438+10月17在日本正式发售。2006年9月28日在美国上映，2006年9月28日在大洋洲上映，2006年10月0日在欧洲上映。