著名名侦探柯南的主线剧情
054电子游戏公司谋杀案，柯南在参加满天堂游戏公司新作发布会时，偶然听到黑组织成员之一的龙舌兰酒叫伏特加。然而龙舌兰酒马上就被误杀了。他最初的目的是通过与电子游戏公司的雇员中岛进行交易，获得世界上最有才华的程序员的名单。当柯南迅速赶到中岛经常聚会的酒吧时，发生了爆炸，线索烟消云散。
128黑暗组织10亿元的抢劫案，因为改编了漫画对应的“013怪杀亲”，所以动画在这里加了一集，叙述了足原君的姐姐宫野明美被琴酒杀死的情节，为后来足原君的出现做了铺垫。从金和宫野明美的对话中，我们知道宫野志保是组织中为数不多的有脑子的人，这和她姐姐只是组织小卒不同。
129一个来自黑暗组织的女子大学教授参与了这起谋杀案。宫野志保，其组织代码是雪莉，抗议她的姐姐被杀害，以阻止对APTX4869的研究，并被囚禁在毒气室。绝望的她拿着藏起来的APTX4969，想自杀。没想到的是，她和新一一样，没有中毒身体萎缩成小时候的样子，还能从垃圾通道逃出来。因为她已经从一个新家庭的调查中发现心怡变小了，心怡成了她唯一的希望。最后，她倒在了一户新人家的门口，被隔壁的阿笠博士救了出来，住进了医生家。作为转学生，她成了柯南的同学，少年侦探队的一员。柯南因此得知了导致他萎缩的药物的名称和大致信息，但阿沙拉暗示这种药物的最初用途并不是毒药。当他们取回被错误送到广田教授家中的含有药品信息的软盘时，他们正准备对其进行检查。没想到，电脑被软盘里的夜男爵病毒感染，数据全毁。虽然芦原隐藏起来了，但是组织并没有放弃寻找叛徒的努力，柯南和芦原从此被卷入了组织调查和反侦察的大戏中。不过，足原似乎没有透露更多关于该组织的信息。此时，她对组织感到极度恐惧。
170-171在黑暗的角落里，新出智明的父亲被继母杀害，小五郎在柯南的帮助下破案。乍一看，与主线无关，但随后的剧情表明，这是青山两年来的一大伏笔，也是三方对决前真正的新出智明唯一一次亮相。为了保护无辜的女佣，警方修改了案件的记录，隐瞒了真正的作案手法，只有真正的新人知道，后来被朱迪用来指证贝尔摩是新出智明。此时的新一还只是迪丹高中篮球队的临时教练，并不是校医。新一本来应该在青森的医院工作，而不是当校医。校医应该是苦艾酒冒充新一进行调查。柯南在《361迪丹高中闹鬼学校(上)》中的话可以佐证。
另外值得一提的是，在这一集里，柯南因为新出智明而吃醋。
176-178告别黑暗组织，柯南和芦原偶然发现了GIN停在路边的车，于是柯南在车上安装了发射器和窃听器，以获取组织的信息。虽然他得知黑人组织成员皮斯科将在河口酒店暗杀议员吞口，但窃听器被琴酒发现并销毁，他还将雪莉与留在车内的棕色头发联系起来，对她予以肯定。一头茶色的头发和阿修罗有关联，证明阿修罗不是组织里的普通人。)柯南和芦原潜入宴会阻止暗杀计划，但他们没有时间，芦原不幸被皮斯科抓住并绑架囚禁在酒窖里。柯南一方面利用警察拖住嫌疑人皮斯科，另一方面提醒足原白喝，为雪利酒逃出壁炉成功挽回。没想到的是，GIN在楼顶等着他，向SHERRY开枪。就在这个关键时刻，柯南带着变声器出现，用麻醉针打死了金妮。雪莉得以趁机从烟囱逃出，回到灰烬中。皮斯科也来到酒窖杀死了足原，但柯南暴露了自己的身份。结果皮斯科被杜松子酒灭口了，死前还没来得及说出足原= =雪利酒的秘密。琴酒在与柯南的对抗中被麻醉针打伤，雪莉也被发现有骑士保护。在这一集里，我们真的获得了很多信息。通过皮斯科的话，我们真正了解到阿沙拉研究的药不是简单的毒药(“已经进展到这个阶段”)，她继承了父母的研究。从后来杜松子酒和苦艾酒的对话中，我们比柯南更早地了解到，苦艾酒就是当时在场的美国超人气女演员克里斯·宾亚德(Chris Binyard)，她给了皮斯科一块紫色的手帕来掩盖他的罪行。后来柯南怀疑皮斯科当时有帮凶，也是基于此。事发后苦艾酒消失，隐居日本。但从她的言语中，并不能明显看出她接受了组织寻找阿舍的任务，而是想“弄清楚她一直担心的事情”。(我猜这种“无时无刻的担心”应该和找新的有关。虽然苦艾酒在组织中受到BOSS的青睐，但她却厌倦了长期生活在冰冷的黑色中。其实她心里一直期待着美好的东西，有一颗银弹划破黑暗，摆脱这种黑暗的生活。在纽约事件中，味美思遇到了聪明勇敢的心怡和阳光善良的兰，两人都给她留下了深刻的印象。纯洁善良的兰花重燃希望，相信世间真、善、美，从此称兰为安格尔。新一自信的眼神和无所不能的睿智洞察力让她相信新一是可以终结黑暗组织的银弹。苦艾酒很珍惜他们纯真的感情，所以从那以后他一直不愿意伤害他们，也多次试图保护他们，即使柯南不走，他也不会去攻击芦原。所以当她得知新一被APTX4869毒死后神秘失踪后，她非常看重的新一的下落就成了她“持续的烦恼”，她也隐居在日本开始寻找新一，所以我觉得是苦艾酒先发现了柯南的身份，然后发现了阿沙拉。在这里，她大概结合了自己变年轻的经历，想到了变年轻的可能性。我猜她变年轻是因为某种巧合，她的细胞被激活重组了。当时，宫野教授因其激进的细胞死亡然后被激活的理论而被称为疯狂的科学家。黑暗组织的老板看到了宫野教授的细胞理论对他的计划的巨大价值，为他的研究提供了资金和资源。苦艾酒的年轻给了宫野教授的理论实际支持。宫野和他的妻子去世后，他们的女儿世保继承了这项研究，但药物没有完成。这个实验阶段的药物造成了实验对象的大量死亡，从尸体上无法检测出毒素，这让该组织看到了APTX4869是毒药的可能性，还可以顺便做人体实验，从而擅自将其作为杀人工具，这也引起了阿沙拉的不满。)苦艾酒决定从小兰开始找新的，于是她瞄准了新出智明的身份，决心杀了他，并冒充他的身份沈丹高中的校医进行秘密调查。味美思利用女演员克里斯·宾亚德(Chris Binyad)的身份，频繁光顾新诊所，调查新的生活习惯和人际关系，准备接替他的位置。这时，从美国跟随她的美国联邦调查局朱迪等人也洞察到了苦艾酒的举动，他们设下骗局，让真正的新人在她面前“意外死亡”。事实上，他们秘密转移，并开始监控新的诊所。苦艾酒看到新家庭在他眼前出事了。虽然很不解，但他还是装作一个新家庭的样子。
188-193的复活，在这个系列中，味美思的新冒名顶替成为了迪丹高中和迪丹小学的校医。柯南在吃了足原研制的解药后，短暂变回了新一，装扮成黑骑士去见兰，却被发现是新苦艾酒，并被苦艾酒偷偷拍下，这一点可以从后来朱迪老师复制的照片中得到证明。苦艾酒在这一刻确认了新一没有死，但是因为乔装成足原诚司的柯南当时也在场，所以还没有猜到柯南=新一。有人说这个时候朱迪也在，照片可能是朱迪拍的。那时朱迪在那里。从227格斗游戏(第二部)的陷阱来看，她在舞会上称赞兰的新作“太酷了”，她一定是那天看到的新作。(此时朱迪已经潜入学校，这本身就证明了另一个事实。这时候苦艾酒已经冒充新的了。不过当时有意调查新一的苦艾酒除外，拍了一张特别的照片。不知道新一是谁的朱迪为什么要专门拍这个素未谋面的男生的照片？所以照片是苦艾酒拍的。
在226-227格斗游戏的陷阱中，朱迪遇到了柯南，并注意到他在花园的帮助下破案。于是，她发现柯南不简单，临走的时候在抄照片的家伙里给柯南抄了苦艾酒的名字。(这一举动也暗示了味美思在她的房间里贴了柯南的照片，已经知道了柯南的真实身份。我猜当时没有宫野志保的照片。朱迪事后给同伴打电话时，给苦艾酒起了个代号“烂苹果”。但她说她的监视对象“改了身份，在学校”，当时就给了我们。她监视的是柯南的误导。
230-231粉丝，一开始，苦艾酒和杜松子酒之间的一场戏，说明这一集和主线有关。我们不仅得到了苦艾酒善于变脸的信息，还知道了她在日本找谁，她的口头禅是秘密使女人成为女人。年轻的侦探队和医生在公共汽车上遇到了一起去美术馆的朱迪和辛楚。这时，艾感觉到车上的组织成员变得很害怕(青山在漫画里告诉我们，这个人是苦艾酒)。后来，大巴被劫匪劫持。虽然在大家的努力下最终抓住了劫匪，但是艾呆在快要爆炸的车里想死，最终被柯南救了出来。朱迪和阿凯在看苦艾酒，不过还好在柯南的掩护下，朱迪和阿凯都没有发现艾。这一集也是赤井秀一第一次正式亮相，但他用假感冒蒙住了脸，而足原因为柯南的保护没有露脸，所以两人都没有找到对方。当穿制服的强盗问朱迪她到底是谁时，她甚至说“秘密使女人成为女人”！朱迪的真实身份是苦艾酒吗？在这一集里，足原的感觉带领我们找到了三个嫌疑人，朱蒂、赤井和信吾。另外值得一提的是，味美思在车上为柯南辩护。少年侦缉队在车上说，他们很感激新医生前几天帮他们体检，但阿沙拉缺席了。新医生可能会通过这次体检，确认柯南就是新一的事实。而且证明了假新奇的目的是新奇而不是丧，否则丧的身份早就被她发现了，这一点可以用“迪丹高中闹鬼学校361”来证实。)本集一开始，味美思发现他的诊所被美国联邦调查局监控，他也知道自己化妆的假新身份已经被美国联邦调查局知道了。(此时美国联邦调查局已经掌握了柯南、小兰、心怡在苦艾酒诊所舞会上的照片，但应该不会到这个时候才贴出。因此，她开始采取一系列措施来误导和利用美国联邦调查局。首先，她故意偷走了所有与毛利人有关的文件，这些文件可以在269-270犯罪纪念品中得知。
258-259一个来自芝加哥的人，美国联邦调查局的头，出现了。柯南等人认识了来自芝加哥的老人“詹姆士·布莱克”。后来被误认为名人，被绑架了。事实上，他是在玩游戏，并尝试柯南的技能。柯南破解了熊猫车的密码，救出了布莱克。最后布莱克甚至称柯南为酷哥，可见他和朱迪是一伙的。赤井在接布莱克的时候说自己被爱人甩了，所以把头发剪短了。PS:在这一集里，赤井的长发和他点一支烟的样子甚至让人怀疑他和琴酒是同一个人！赤井在开车的时候被柯南和足原看了一眼，足原有了奇怪的反应。柯南说布莱克先生不是坏人，但他担心詹姆斯这个名字和莫格里亚教授(和詹姆斯·莫格里亚同名——夏洛克·福尔摩斯的宿敌)一样，怀疑赤井。
情人节的真相266年到268年，有人看到京极真戴着黑色针织帽，柯南以为是赤井，非常紧张。小兰说她可能认识这个戴黑色针织帽的男人，这引起了柯南的注意。
269-270，犯罪纪念品，从高木那里得知，在巴士劫持的当天，毛利小五郎的相关档案被盗，然后被送回，暗示有人在调查他们，这让柯南相当紧张。(后来，据苦艾酒说，偷走了所有与毛利小五郎有关的文件，让人不知道她其实是在寻找一个新案件的记录。她在寻找一个新案件的信息，以躲避柯南和其他人。虽然美国联邦调查局已经知道了自己的真实身份，但为了不暴露自己与小兰、柯南等经历过此案的人的接触，她还是想掌握案件的信息，但没想到还是被改变了。把它送回去是在误导美国联邦调查局认为她在日本逗留的目的与毛利侦探有关，这样美国联邦调查局就可以监视毛利人的事务所来暴露她的身份。故事的最后有一张赤井监视毛利侦探所的图片，说明美国联邦调查局确实把目光转向了毛利，但是却给人一种赤井在监视柯南的错觉。而柯南想问兰关于那个戴黑针织帽的人，最后也没说出来。
271-272匆忙掩饰疏忽，柯南再次在朱迪面前破案。从朱迪警告说兰没有被跟踪来看，案卷失窃引起了的警觉，朱迪怀疑这个黑人组织会对毛利人不利。在她的对话中，朱迪用鸵鸟这个词来形容柯南的孩子们拥有成年人的智慧，并提到bureaus代表美国联邦调查局。在这一集的结尾，朱迪说是时候收获苹果了，暗示美国联邦调查局将对苦艾酒采取行动。苦艾酒给金酒发了邮件，提到了“藏了很久”的雪利酒，给的十字绣照片发了飞镖，还有柯南和兰的照片。(我猜测苦艾酒在《188-193复活》系列中暂时找回了柯南，她认为智宝可能在附近为柯南配置了解药，决定找出并摧毁它。她利用美国联邦调查局监视诊所的机会，贴出了雪莉的照片作为目标，希望美国联邦调查局能帮她找到雪莉。)
277-278英语老师VS西方某著名侦探。医生得知毛利小五郎的相关档案被盗后被送回，于是邀请平姬帮助柯南。他们分析偷案卷的人是一个引诱人出来的陷阱，然后柯南回顾了皮斯科的案子，怀疑克里斯是他的帮凶，进一步怀疑朱迪=克里斯。虽然他们看起来完全不同，但柯南知道克里斯擅长化妆。于是他们去朱迪的公寓探查，让医生在网上调查克里斯的信息。双方接触过程中发生了一起命案。虽然案子破了，但是对朱迪的诱惑没有成功。这一集的重点是柯南、兰和新一在舞会上最后出现在朱迪浴室镜子后面的照片，照片上的字迹和味美思的一模一样。据后来的叙述，这是朱迪潜入新医院发现相关照片后复制的。但是这些照片当时的样子显然误导了我们很多，她最喜欢喝雪利酒的暗示更是雪上加霜。另外，柯南最后说，除了朱迪，另外两个可疑人物应该是赤井和信吾。
279-280迷宫的黑暗，在柯南的要求下，医生查看了克里斯网站上的信息，发现她是已故美国明星莎伦·宾亚德的女儿。她第一次面对媒体是在她母亲的葬礼上。面对记者的追问，克里斯神秘地回答:秘密让女人变得女人。此外，这位日本前超人气女明星也出现在了莎朗的葬礼上，从画面上看是Hiko。我想正是基于这个证据，柯南推论莎伦和克里斯其实是同一个人。)
284-285似曾相识中华街上的雨，
286-288纽约事件，继蓝回忆的“戴黑针织帽的人”之后，又叙述了蓝发高烧时的金苹果事件。他还讲述了心怡与兰、莎伦的第一次相遇，以及他们对银发杀手的救命之恩。最后提到真凶其实是被别人灭口的。后来才知道，假凶手是苦艾酒演的。这个计划原本是要把一休引出来杀掉，但是没有成功。
309-311与黑暗组织有联系。在案件开始的时候，柯南和兰认识了。在交谈中，赤井提到了一个表面坚强的女生，暗自落泪。宫野明美，他的女朋友。有人提到很难理解赤井说兰“经常”哭。其实这是因为赤井曾经监视过毛利侦探社，所以多次看到兰偷偷哭泣。此外，柯南还得知了兰与赤井的相遇，并得知了赤井饰演的的身份，这大大减少了赤井的怀疑。通过看板仓的日记，我知道黑组织委托他开发一个对人类有害的软件，但他最终没有完成。柯南诱骗伏特加更改交易时间，试图伪装成板仓和伏特加的接头，以此获取他的指纹和行踪信息。没想到，就在他快要成功的时候，因为杜松子酒的突然出现而功亏一篑。柯南差点被发现，最后躲在储物柜里侥幸逃脱。当柯南和艾最后离开的时候，赤井和艾在附近似乎互相有了感情。
335-336杜东开发院的秘密是Hiko回到日本，带着侦探队去杜东开发院看电影。在路上，习字和柯南发现他们被跟踪了。柯南认为跟踪者要么是冲着他来的，要么是冲着灰原来的，很可能是黑组织的人。其实后来才知道，赤井的人在看柯南等人。末了，赤井还拍了少年侦探队的照片，看了看说太像了，说明美国联邦调查局被苦艾酒困住了，帮她找了小一点的雪利酒。但当时就让人觉得赤井可疑。
338-339 4保时捷，柯南奇怪的一开始就骗医生说新车不在家。他为什么不诚实地告诉医生他对新车的疑虑？但是后来，这位不知名的医生还是找到了一位新医生来看萧艾。苦艾酒冒充新医生正式确认Ai就是雪莉，在医生家里装了窃听器，但是朱迪也在场，所以当时我们把所有的疑点都加到了朱迪身上。末了，苦艾酒冷笑着用打火机点着了雪莉的照片，得意地自言自语道:“给你...你准备好了吗？我来找你了！”苦艾酒准备采取行动了。好像要下雨了。
340-341藏在厕所里的秘密柯南、足原和博士来到足原父亲宫野博士工作的办公室，想得到一些关于黑组织的信息和足原父母的下落。结果，他们在厕所里发现了宫野明美母亲留下的带子。这一集揭示了很多。一开始柯南说“如果我推理正确，我们应该早就死了”，证明他已经知道克里斯在假扮新电影，阿莎拉和他的身份已经暴露，只是他不知道她为什么还不采取行动。足原找到了明美藏起来的带子，妈妈的脸浮出了水面，由此而来的是“地狱角”。18生日结束时她妈妈留下的话里应该提到了一件很神奇的事，但是青山没有解释。末了，苦艾酒一边从机场出来一边讲电话。从对话中，我们得知她找到了一个叫卡尔瓦多斯省(苹果酒)的组织成员，这似乎是她下一步行动的重要部署。另外，值得一提的是，在阿沙拉的梦里，青山已经给出了苦艾酒装扮成谁的暗示。如果他的眼睛没有问题，他一定会发现的。
在便利店343-344的剧情中，柯南发现了有人来工藤屋的痕迹，而且不是小兰。朱迪老师突然辞去了在迪丹高中的英语老师的工作，说她想回美国。(其实是时候对苦艾酒采取行动了。)在欢送会上，小兰无意中发现了朱迪在朱迪浴室的镜子后面藏着的自己和柯南、足原等人的照片，不禁产生了怀疑。这也促使她在下一集偷偷躲在朱迪的后备箱里，去寻找自己真正想做的事情。
345与黑组织对抗月圆之夜的二元推理。柯南收到了一封来自苦艾酒的信，邀请新一参加化妆舞会，称之为江户川柯南！柯南知道自己的身份暴露了，决定采取行动。他一方面邀请服部哲假扮新一参加化妆舞会，另一方面用麻醉针麻醉阿沙拉，假扮成她为自己的组织做准备。来接他的不是苦艾酒的假新人，而是朱迪！事实证明，美国联邦调查局也有自己的计划。他们准备靠苦艾酒一步一步走下灰平原，引诱苦艾酒跟着它到码头，然后逮捕它。(柯南这时应该还不能确定朱迪和新来的谁是苦艾酒，他们可能是一伙的，所以他装上了窃听器。)朱迪在车上表明了美国联邦调查局的身份后，柯南告诉她新案件的真相(170-171)，并让她用它来揭露苦艾酒，以此来为自己谋利。朱迪暴露了苦艾酒既是克里斯·宾亚德又是莎伦·宾亚德，但当她叫她的同伴去逮捕苦艾酒时，她被埋伏的卡尔瓦多斯省打伤了。原来苦艾酒更擅长下棋。她很久以前就知道了美国联邦调查局的逮捕计划，事先装扮成朱迪来到码头命令埋伏的美国联邦调查局特工撤退。此外，味美思早就知道美国联邦调查局在监视这家新诊所。偷案卷是为了引诱美国联邦调查局暴露身份，贴宫野志保的照片是为了利用美国联邦调查局寻找目标。就在朱迪处境危险的时候，另一边的化妆部门在舞会上破案，扯下了伪装。柯南还撕下面具，用麻醉针控制了苦艾酒。柯南的策划终于笑到了最后。但就在这个时候，情况突然发生了变化，担心柯南安危的阿沙拉突然用备用追踪眼镜发现了它，破坏了柯南的伟大计划。味美思趁机用麻醉针射杀柯南，并将手枪对准了阿沙拉！就在局面失控的时候，小兰突然从朱迪的汽车后备箱里跳出来保护灰原，阿凯也及时出现，逼迫苦艾酒挟持柯南，逃离被告席。就在味美思给BOSS发邮件报告的时候，他突然发现柯南有个发射器。原来柯南留了一手。他已经预料到当他找到阿修罗时，苦艾酒会向老板报告。苦艾酒不得不承认放弃了雪利酒。为了避免暴露BOSS的邮箱地址和身份，味美思不得不使用催眠气体，并开枪自杀以保持清醒。在破坏了发射器后，他惊慌地逃离了现场。
425黑撞击！在被组织魔爪触碰的瞬间，柯南通过忘记找回bug，发现了惊人的秘密！原来，电视主持人水无怜奈也是黑人组织的成员。柯南偷听了她和金的暗杀计划，并成功阻止了他们。不料琴酒发现水里有一只没有脚掌的虫子，而小五郎却被他们怀疑，有生命危险。幸运的是，秀吉及时出现，打伤了金酒，并把窃听器放到了美国联邦调查局上。苦艾酒也再次保护了毛利等人。代号为KIR的水无怜奈在手术中受伤昏迷，被美国联邦调查局送往Cuphouse中心医院控制。此外，柯南得知布莱克也和美国联邦调查局在一起。
429-430回不到以前的两个人了。小兰的倒霉蛋同学应友出现在这个大厅里，眼神和水的不太像。他好像注意到柯南是通过毛利语破案的，这让柯南感到很不安，怀疑这个大厅的身份。
462黑组织的阴影，一个年轻的目击者，一个孩子目击了一个歌手被人从桥上扔下来。这个大厅用了和水一样的脉冲测谎仪，引起了柯南的怀疑。
463.黑色组织的阴影被奇怪地照亮了。我们几次试图提醒毛利人和其他人缺水，以获取信息，但柯南看到了，改变了话题。
464黑组织神秘阴影重赏。这个大厅故意引诱毛利人注意到发生在一个孩子家里的奇怪事件。这个孩子目睹了水无怜奈受伤。他说，他的母亲在去世前曾与陌生的外国女子交谈，并打听水无怜奈的下落。
465.黑衣组织的影子珍珠流星，当孩子正要说从摩托车上摔下来的是主持人水无怜奈时，柯南及时用一个蒙面超人转移了话题。柯南通过外国女性对孩子的回答“分泌者使女人成为女人”，推断这个女人是苦艾酒。另外，金在本期节目中所说的水没有得到老板信任的事情，也说明她与一个叫的卧底之死有很大关系。
服部哲调查484-485的黑照下落无果，却意外查出了唐唐和他父亲在大阪的生活状况，因为英佑小时候曾经和父亲一起去过大阪的烧烤屋，他父亲和店长很合得来。然而，商店经理已经去世了，所以柯南，阿笠博士和足原决定去拜访住在东京的商店经理的孙子的房子，希望从他那里获得一些关于这个大厅和他父亲的信息。没想到的是，这位模型爱好者西郡的家中发生了一起盗窃案。成功解决后，柯南终于无意间看到了应佑拍摄的照片，并在照片中见到了应佑的父亲，得知应佑的父亲经常穿着黑色西装与外国人打交道，并在公司(=CIA)工作，还一度进入了黑组织。001过山车杀人事件(组织)
054电子游戏公司谋杀案(组织)
129来自黑暗组织(组织)的女子大学教授谋杀案
170，171暗阁死角(新外观)
176，177，178告别黑暗组织(组织)
188-193危急生命复活(兰)
226、227格斗游戏的陷阱(朱迪出道)
230，231谜一样的乘客(阿凯出道)
来自芝加哥的258，259人(詹姆斯在现场)
269，270件犯罪纪念品(其中提到了警方关于毛利人的档案被盗)
271，272遗漏紧急隐藏(朱迪)
277，278英语老师VS关西侦探(朱迪)
286、287、288工藤新一纽约事件(不用说了)
289，290失落的森林里的广彦(上集和下集)(提到Ai对组织气味不再敏感。一郎沼羽是该组织的成员。)
307，308无声证词(组织关联，下集介绍)
309，310，311接触黑色组织(组织)
335、336杜东发展学院的秘密(与神秘人)
338，339 4保时捷(朱迪和贝尔摩假装是新发现)
340，341藏在厕所里的秘密(更多关于丧父母的信息，找明美的隐藏录音带)。
便利店343，344的陷阱(不用看，就是最后一段是小兰发现朱迪藏身并怀疑朱迪的照片)
345面对面对抗黑组织月圆之夜双重谜团(不多说)
346，347寻找P股上的印记(案件最后一集，关于证人保护计划被拒)
还有一些案子本身没什么，期间一两句和组织有关系，或者丧中有隐情，可以不看。
130，131竞技场内的无差别胁迫事件
222，223，224导致死亡的人鱼传说(人鱼岛的花名册上有宫野志保的名字)。
242元简直是灾难(好像杜松子酒是左撇子)。
神秘在246，247网(艾和兰握手)
279，280迷宫的阴暗(这一集已经说了很多)
312，313木偶戏感染夕阳(哀悼夕阳)
335杜东发展学院的秘密(上)
336杜东发展学院的秘密(下)
338 4保时捷(第一部分)
339 4保时捷(第二部分)
340厕所隐藏的秘密(上)
341厕所隐藏的秘密(下)
343便利店的陷阱(第一部分)
344便利店的陷阱(下)
345与黑组织对抗月圆之夜的双重神秘。
346寻找屁股上的印记(第一部分)
347寻找屁股上的印记(下)
361迪丹高中闹鬼学校(第一部)
362狄丹高中闹鬼学校(下)
374颗星星和香烟的代码(上)
375颗星星和香烟的代码(下)
385斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐(前奏曲)
386斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐(间奏)
斯特拉迪瓦里小提琴的不协和音(完)
425黑撞击！黑组织魔爪伸出的那一刻(水无怜奈出现，小五郎被怀疑，如果不是秀吉，他早就死了)
462黑色组织的影子，年轻的证人(有组织影子的人)2007/01/29
463黑色组织的阴影奇妙的照明(组织阴影的奇妙照明)2007/02/05
464黑组织暗影之谜的高额悬赏(组织暗影之谜的高额悬赏)2007/02/12
465黑色组织暗影之珠流星(黑色组织暗影之珠，流星)2007/02/19
484张黑人照片的下落(第一部分)、肖像和聚会(第一部分)
485黑人照片的下落(第二部分)、肖像和实践(第二部分)
491-504红与黑的碰撞(系列)，主要讲的是颖友、水无怜奈、赤井秀一。