GBA版本的龙战士
第三章：光明与黑暗
过了被熔岩填没的小河，发现了一座龙族全盛时期遗留下的建筑。因为龙得到了“勇者之徽章”被允许进入遗迹接受试练，（必须由龙带队！不同的人领队可能使剧情发生变化这点必须注意。）成功后龙终于拥有了变身成龙的能力！
龙还发现在一片树林里聚居着许多妖精，另外树林附近的地方有个男孩不断围绕着花丛转圈。穿过地洞来到一个名叫“ひかりのまち”的港口城市，刚进城就被士兵抓入监狱，监狱的水槽中可以得到一件囚衣装备后升级时会大幅提升能力值！牢房中有个黑脸小个子悠闲的躺在床上呼呼大睡，龙上前搭讪那小子问他们是不是想出狱，得到肯定回答后他起身很轻松地就把牢门打开然后有自顾上床大睡。虽然有些古怪但毕竟重获了自由，这座城市十分繁华当然要挨门挨户洗劫一番啦！在一幢房子的二楼如果是尼娜领队浴室的老头会要求异性按摩，哇塞！报酬竟有两万元。另一幢房子中有位妇女正为失踪的儿子担忧，龙想起了途中遇见的那个男孩。（回到原来地方先和树林中的妖精交谈，然后再到花丛处请妖精护送男孩回家，事成后也会得到奖金两万元。）城中的大富翁ロズオーダ拥有着港口的海船，他正在为爱子患有的忧郁症而担忧。到地下室可以看到他的儿子自锁密室中。
在光明之城“ひかりのまち”逛了一圈才知道这座城市的特殊之处是没有黑夜！到海底族开设的商店中花六万五千元买了一个黄金器物“きんののべぼう”，商店楼上还可以找到一个逃到此处的龙族同胞。毫无进展情况下众人前往传闻中获悉的另一座奇特的都市黑暗之城“やみのまち”。
穿过光明之城右侧的山洞，附近砂地上有座高塔暂时无法进入。不远处就是黑暗之城。（在沿途会出现经验值很高的金色史莱姆建议稍作停留。）黑暗之城果然名副其实，城中的居民谈吐都十分怪异。交谈中获悉了有关“光明钥匙”和“黑暗钥匙”的事情。和长老对话后用黄金器物“きんののべぼう”交换了“こおりのせんす”！
黑暗城左行进入山洞到达沙漠，在沙漠族的营地ヂューン帮助击退砂虫得到“とぅぞくのふえ”。利用“とぅぞくのふえ”进入大盗贼的墓地，因为墓中所有的宝箱都有机关所以不忙先开！下到墓地三层岩石上插着一把回旋镖无法取出，只得打倒守卫楼梯的眼球怪进入传说收藏“大盗贼秘籍”的密室。谁知打开宝箱后却启动了机关，危急关头盗贼丹克赶来了。这不是光明之城监狱中的黑小子吗？！原来丹克到这里是为了获取传说的“大盗贼秘籍”，交谈后丹克也加入了冒险行列。（丹克的技能是开锁和发现机关）经过调查大家终于发现“大盗贼秘籍”原来镌刻在墓的八口石棺材中，丹克如愿以尝地成为真正的大盗贼！
回到黑暗之城进入邻近的高塔取得黑暗之钥匙“やみのかぎ”，黑暗之城恢复了昼夜变化。再到光明之城，先跟ロズオーダ的儿子说话，然后和ロズオーダ交谈，其间ロズオーダ亡女アイナ的灵魂出现说明原因。最后龙获准到密室取得了光明之钥匙“ひかりのかぎ”，光明城也恢复了正常。
获得ロズオーダ使用海船的许可龙前往码头，船长报告说船已经被黑龙帝国强占！海船边遭遇了帝国官兵，战斗后帝国军炸沉船逃走了。正在无奈之时船长带来个海底族的商人曼尼洛，曼尼洛声称在某处藏有一艘帝国军火船但向龙敲诈黄金器物（真黑啊！）。直到如愿以偿他才开口。
进入原先从タタール镇到光明之城的山洞左行，用炸药炸掉拦路的碎石后来到帝国的秘密基地夺取了军火船。回至光明城码头告诉船长已经得到船只，告别了ロズオーダ父子一行人和随后赶来的曼尼洛泛舟西去！
第四章：魔卵
船行至中途遭遇了黑龙帝国大批船队的围攻。奋力打败登船的帝国将军后敌人竟点燃了舱底弹药的引线，情急之下曼尼洛带领大家跳海逃生。
火药的爆炸引起的连锁反应把帝国舰队也完全摧毁了，旋涡把所有人卷到一个孤岛上。曼尼洛说只有取得潜水面具众人才能下水，当龙向他求助时再次狮子大开口敲诈一百万元，没办法只好先答应了再说吧！
接下来是曼尼洛的单独行动了，以他稀松的身手很容易被敌人打倒。使用まものりけむり来到海底的商业都市マッカ，（战败后也会自动来到マッカ的记录点但所持金会减半）这里是曼尼洛的故乡，似乎族人对曼尼洛的口碑并不佳。（贪污犯？！）族长告诉曼尼洛蛮人都市カンツ擅长打造铁器，获得确切消息后曼尼洛只身前往南岸。
不知什么原因カンツ镇的壮年都不见了，找到老铁匠说明原因后，老铁匠告诉他マッカ的族长处有潜水面具。回到マッカ向族长索要了正想离去屋外传来异常响动，原来救起了一个蛮人青年。眼见那青年奄奄一息曼尼洛要求族长救治却被敲诈了五千元！（乌鸦一般黑）龙众人进入マッカ后赶走了蛮人青年头上的死神，苏醒后那人自我介绍叫贝鲁达。贝鲁达是因为反抗帝国抓捕劳役而不幸坠海的，为了拯救族人他也加入了冒险行列！（贝鲁达的技能是蛮力！可打碎岩石和敲击树干获得果物。）回浮游城让贝鲁达打破墙壁取得道具，利用丹克的开锁技能在城第四层右上方墙壁缝中找到基力亚姆的专用武器。调查第五层门左侧的雕像可获得龙的强力防具。再去到“大盗贼之墓”让贝鲁达拔出石上的折断之回旋镖。一切准备妥当后大家向マッカ西岸的帝国要塞杀去！（在カンツ镇的密室丹克可以学习到与基力亚姆、曼尼洛两人合体的超级能力。）
要塞有层层重兵把守，打败BOSSナイトブリーブ后救出了所有的蛮人族男性村民。穿过一片生栖着许多石化鸡的树林来到敌居城ナバルのしゐ，因守卫森严不得不暂时回到カンツ镇，老铁匠帮助龙修复了回旋镖。カンツ镇入海口往东的椰林中居住着一位神秘的老者，老者显然知道回旋镖的来历，他对龙等人的实力十分惊讶，指点了龙关于石化鸡和蛋的一些秘密！
去到生栖着石化鸡的树林，鸟巢中果然有个奇怪的蛋，而且原先林中的一个蒙面人已经消失。为了夺取蛋和石化鸡发生了冲突，取得蛋后慢慢把石化鸡引出树林来到ナバルのしゐ，（注意要让石化鸡跟上步伐）乘混乱之机突入城中。帝国军头领留下三个喽罗断后仓皇逃走。救出贝鲁达妻子等一干女村民后到マッカ和海底族族长交谈获悉情况已经十分危急，唤醒族长家楼上的老人在其床上得到重要道具“しゅごしんぞう”。众人前往沙漠寻访伟大的女魔导师迪丝（ディース），在废弃的古代都市（さまよえゐまち）中只有精灵在此躲避喧嚣的尘世，而迪丝已经被封印了数百年的漫长岁月。打败看守的精灵后唤醒了她，迪丝似乎对龙的营救并不太在意，警告龙在森林中得到的那枚蛋危险性后就又自顾睡去了！
众人商议后决定把蛋投入海底火山。销毁了蛋以后迪丝加入了冒险队伍，由于大魔导师助战海底族决心抗击黑龙帝国的侵略。一场大规模战斗后将帝国军赶出了这片海域，对此黑龙王ソーゴン十分恼怒！勒令ジュダス火速消灭龙等人，ジュダス召唤手下四天王准备行动。另一方由于曼尼洛的功劳海底族族长赋予他特殊能力，曼尼洛终于可以变身成大鱼载众人穿过海底的大裂缝。
注：在海底城マッカ和以后的音乐城都有空摊档供曼尼洛经商，如果幸运的话会买到各人究极的装备；如贝鲁达的碎星槌。
第五章：虚幻
过了大裂缝后来到位于海岛上的音乐城（おんがくのくに），这里的居民都用音乐进行交流。龙由于无法和他们交谈而暂时一无所获，不过在楼上宝库被石巨人推下地洞后移动箱子会得到本游戏极重要道具最强钓竿（たくみのさお）！最奇特的是在一间屋子里看到个和尼娜一模一样的有翼族少女。
下海后北行登陆，来到山间小镇かぜのむら。在这宿屋下方房子里的密室丹克又能学到一种合体技能。不知什么原因这个村庄的许多青年男女都处于莫名的兴奋状态，而村西的羊圈被一只金色的苍蝇（さんのぼえ）所占据。
向北出村在山道上一株硕大妖异的魔花正不断喷洒着花粉，看来村中青年的怪异状态与此有关。必经之路的木板桥不知何时已经被拆毁，为查明原因龙进入桥畔的洞窟探索。在洞窟二层遭遇四天王之一的してんのうキュラ，施用魔法把众人变得很小后扬长而去。幸好在墙角发现了一个鼠洞，消灭了霸占洞府的蟑螂群后老鼠也帮助龙他们解除了魔法。下到魔法坩埚炉キュラ召出一个强悍的红色巨人后再次离去，巨人被打倒身上的魔咒也同时消失，竟然是かぜのむら镇叫ニコル的青年，把ニコル抬到村口他姐姐ユナ也闻讯赶来，迪丝诊断后认为キュラ所施的魔法还有复发的可能必须赶快找到解药。
先到村中羊圈里抓获金色的苍蝇，来到ナバルのしゐ左边的水洞中和青蛙交换かえゐのしゐ回村交给迪丝配制成解药。服药后迪丝又叫龙去铲除祸害村庄的毒花，毒花原来也出自キュラ的手笔，根绝了巨大化的毒花后キュラ只得再次逃走。回村时狂乱的青年们都恢复了理智，而ニコル却再次暴走！打败了他后キュラ的魔法彻底解除了。在宿屋下方屋中床上得到めいじんのぷえ。
一行赶到桥边，此时ニコル又倒在刚修复的桥面上昏迷不醒。这次无计可施的キュラ亲自上阵变成デビマンダー和龙决战，他的身手可比不上脑袋诡计百出，招数单调且威力一般，击败キュラ后过桥。
过桥后是一片平原，平原上有个地洞，一个小小的脑袋不时探出来四下张望。进洞才知道这是地底族的部落グラモール，全族人都在为昏睡不醒的莫古（モグ）担忧。老人交给龙一件乐器ききみみずきん（作用是可以听懂音乐城居民的说话），说音乐城可能有唤醒莫古的办法。
白天进入音乐城（可以使用光明之钥匙），和长老交谈后与女王面会，女王似乎对黑龙王ソーゴン很有好感而拒绝了龙希望得到时间之钥匙（ときのかぎ）的请求。晚上（使用黑暗之钥匙）女王正在入浴拒绝会客，龙来到二楼花盆后可以偷窥到女王背上奇怪的记号。在来到宝库和长老交谈，在长老的左右边各调查一次就会发生情节！女王率兵前来和迪丝发生了激烈的冲突，谁都没有料到从宝箱中出现的是四天王之一的“してんのうカーラ”…第二天在宝库中取得“セラピのまくら”赶回グラモール。
众人冒险进入莫古的梦境中，梦境中来到一个开满鲜花的小村。出村前往北方的白塔，守卫白塔第一层的梦精灵（ドリーマー）任何攻击都对它无效，逃走回到小村时见莫古的妹妹已在等候。谈话后才知道先要去南面的洞中寻找勇气（ゆうき），原来这就是迷失自我的莫古。在所有族人的鼓励下莫古终于恢复自信加入了龙等人的队伍中！
再次进入塔中。梦精灵见莫古已经恢复慌忙逃走，追到顶楼将它打败后回到现实世界。（莫古的技能是可在松软的地上挖掘。）
はゐのむら镇。最近气候的变异使这里异常寒冷，连瀑布都凝结成了冰，这些都和四天王中的してんのぅジグムト来到镇西气候制御塔有关。利用莫古钻地的技能进入塔中，ジグムト等候在制御装置前，他使用魔法把龙等人移送到异次元空间，这个空间实际是所有人精神世界的混合体！途中一个叫りょうしん的人指点龙穿过一个旋转迷宫找到了ジグムト。战斗初期ジグムト将真身隐藏在幻象中时魔法抗性很强，结界打破后则物理抗性转强，打败他脱离异次元空间取得天之钥匙（てんのかぎ）。使用天之钥匙启动气候制御装置，众人出塔看时已是冰雪消融、大地如春！
回到はゐのむら镇大家都十分高兴，只是有位老爹因为气候的突变而患病，一时也没有医治的药物。进入雪融后的瀑布山洞南行。村北的池塘里龙使用最强的钓竿（たくみのさお）可以钓到传说的龙之铠甲（ドラゴンアーマー）。
注：钓鱼所需各种鱼饵可在海底城右上角道具屋买到。
第六章：爱与哀愁
离开はゐのむら镇南下途经一个林边小村，进村才发现时间在这里似乎完全停顿了！人和禽兽像石雕般毫无生意、风车不再转动、喷泉之水停止了激涌、甚至连屋顶上的炊烟也在半空凝滞不散…在这死一般寂静的村庄中只有一个叫エラン的男子没有受到任何影响。
エラン介绍这里是チャムのむら，他并没有说出自己安然无恙的原因，隐讳的告诉龙此处时间停止的原因与高原上时间之塔有关！去时间之塔途中见到一颗参天大树，使用贝鲁达的特技可得到一枚“ホリディのみ”，听说是珍贵的药物还是先妥善保存着为好！
众人在时间之塔再次遇见了“してんのうカーラ”，正当カーラ试图对龙等人使用“时间黑洞”的魔法时。她突然从镜像中发现了エラン，惊愕之下カーラ的魔法没有成功，龙一人被抛到大树之下。回到チャムのむら和同伴会合，迪丝一针见血地指出エラン本人一定知道事情的真相！エラン告诉大家カーラ是他以前的恋人，表示愿意解决这一事件就独自离去了。
再去时间之塔看见エラン正在劝说カーラ，希望她能回到原来的样子。カーラ拒绝了エラン的规劝和龙动起手来，眼见不敌カーラ再次使用“时间黑洞”，龙、尼娜两人被カーラ转移至她的居城前，カーラ恨恨地对龙说马上也会尝到爱人分离的滋味就躲进了城。回到チャムのむら看到迪丝等正在救治重伤的エラン，エラン详细向众人述说了当年和カーラ相恋的往事。エラン告诉龙以前到カーラ居城去的信物是“ホリディのみ”！
“ホリディのみ”果然是开启カーラ居城门户的凭证。经过大家的劝说カーラ终于同意交出手中的时间钥匙（ときのかぎ）来救助チャムのむら的村民。这时四天王中的“してんのうゴダ”突然出现指责カーラ背叛了帝国，カーラ让大家离去自己单独面对ゴダ。众人逃出城外看见エラン蹒跚赶来，エラン说无论生与死都将和爱人在一起。空间发生了剧烈地扭曲，看着カーラ之城和城中的一对爱侣消失在眼前，众人心中无限悲哀和惆怅！
时间之塔中尼娜自告奋勇上前开启制御装置，谁知空间发生了扭曲…众人被传送到了音乐之城，惟独尼娜不见踪影。城中的记录点附近出现了一个奇怪的金发男子，那人对チャムのむら的现状十分关注。龙的直觉认为原先在城中看到那个和尼娜模样相同的少女可能就是本人！但和那少女交谈却不得要领，众人只得先回チャムのむら看看。
チャムのむら终于摆脱了时间的咒缚，和所有村人对话后获悉黑龙帝国的首都就在赤水河的对岸。在村右上角再次发现奇怪的金发男子与之对话后消失，（在原位置调查可得重要道具つうこうしょ）然后再次进入村右上角的屋中，一个人告诉龙配制记忆秘药オリザニン所需的四种药材：海椰果（わだヤシのみー可让贝鲁达敲击海椰树获得）、光之石髓（ホリのねっこーグラモール附近一株单独的龙舌兰下让莫古挖掘得到）、白鹿角（しろしかのつの）、毒河豚（どフグー赤水断桥上钓得）。
前往赤水河途中经过原先カーラ城的旧址，发现有一男一女两个小孩正在嬉戏，男孩追着女孩口中叫着她的名字：“カーラ！！”随即两人都跑得不见踪影了…
第七章：再遇
赤水流淌着剧毒的红色液体,唯一的通道石桥也已被破坏。钓到毒河豚回到チャムのむら，老人马上配制了秘药オリザニン。到音乐城让尼娜服下后恢复了记忆，尼娜还获得了变成大鸟空飞的技能！
为了准备最后的决战，需要四处寻觅古代龙的神秘力量。先飞到カンダベル北方一处有龙头记号的地方让莫古钻洞进入后丹克可以学到新的合体技（能推开重物），这样的龙之宝藏各地有许多须仔细寻找。到黑暗之城利用丹克的新合体技推开屋中的木箱能学到丹克最终的四人合体技！利用四人合体之力还能打开各地龙之封印的石门取得其中藏宝。
至于本游戏最大秘密“真-龙皇帝”则必须先到世界的枯井中钓到龙之铠甲（ドラゴンアーマー）以外的其他三件龙之装备，然后先去カンツ镇以西的龙之遗迹让龙学到第二阶段变身能力。再去往かぜのむら以北岛上的遗迹学会第三阶段变身。最后进入ロメロ镇附近以前取圣水的地洞，潜入水下遗迹接受龙族最后的遗产就能取得“真-龙皇帝” 的究极能力（同伴八人合体攻击威力惊人！）
取得了所有的古代遗产后，龙等八人向黑龙帝国最后的据点发进。虽然有毒沼与大河阻挡，尼娜的飞行却无往而不至！使用つうこうしょ混入城中，却发现城中的升降装置已经关闭。守卫士兵之间还传播着城下生栖着地底族的说法。转了一圈后回到はゐのむら镇从生病老人那里得到ふはいのかぶと。再到カンツ镇东椰林的牧羊老人那里取得いちらんひょう，往北飞至居住着一个红衣老人的孤岛把いちらんひょう交给她换取了へんなもの。如此往返数次最后得到了重要道具“はがんのつぬ”！转至カンツ镇请老铁匠铸成了控制开关“そうちのぶひん”。
安装控制开关后到达塔顶，守在门口的神秘人说需要龙之死亡旋律ドラゴン.ソウル才能打倒黑龙王ソーゴン！在夜间进入音乐城可从一吹笛少女那里获得了龙之死亡旋律的曲谱，回到黑龙之塔神秘人已经消失不见。杀入玉座之间见到万恶之源ソーゴン，ソーゴン露出原形ー巨大的黑龙试图顽抗，当龙吹起死亡旋律时ソーゴン（也包括龙自身）的HP变成1格，原来这首笛曲针对龙族有强大杀伤力！ソーゴン被消灭时黑龙之塔剧烈地动摇着玉座之间开始崩塌，坠入地底的龙意外地发现了失踪多时的姐姐セィラ，姐弟倾诉别离之情后セィラ告诉大家会见女神ミリア需要使用天、时间、光、暗、大地等六把禁断的钥匙，同时セィラ还出示了从ソーゴン那里取得的最终之钥匙。正当龙把所有的钥匙都交到她手里神秘人突然出现了，原来神秘人就是ジュダス！ジュダス为了实现自己的野心不但暗中利用龙等人铲除了最大障碍ソーゴン，还操纵セィラ骗取了所有的禁断的钥匙。ジュダス狂笑着携セィラ遁走了！
姐弟的再会竟然是这样的结果，正当龙万分沮丧之时地面上突然出现了一个小洞，原来是一群世代定居在黑龙城下的地底族人，由于ソーゴン灭亡时的巨大变故搅乱了他们平静的生活。来到地底众人发现原先的出口已经完全被破坏，长老不慌不忙地施展出究极的奥义-螺旋掘地大法在坚硬的岩石地上打了个出口。莫古将所有的同族带领到故乡グラモール居住，长老把奥义传授给了他！
众人赶往浮游城，ジュダス已经利用禁断钥匙把封印打开。追入封印之塔后セィラ阻挡在必经之路，龙面对着姐姐化身的白色巨龙十分迷茫，但为了全族全世界的安危只能将之打倒！生命即将终结的瞬间セィラ终于摆脱了ジュダス的精神控制，最后祝愿了为正义战斗而日益坚强的弟弟后阖然而逝。
得到了古代之力的ジュダス制造大爆炸破坏了封印之塔，龙调查封印之塔可以找到最强回旋镖（スライサー）。回到ドラグニール接受了龙族长老喻示向女神ミリア及其信徒发动了最后的决战。
第八章：真实的正义
女神的神殿已经从赤水中浮出，利用莫古的掘地术进入神殿内部。首先挑战的是四天王之一“してんのうゴダ”变化的石巨人，ゴダ的物理攻击力十分惊人，战斗开始时应该让尼娜使用全体防御提升的魔法ミカテクト，打倒石巨人后进入神殿地下二层。
选择下方的传送装置可到达ジュダス的所在，交谈中龙断然拒绝了ジュダス的劝诱，ジュダス变身后的形态极为丑恶，其雷电攻击具有一击必杀的威力所以需随时注意回复HP。如果变身成真-龙皇帝就很容易搞定了！ジュダス被打倒后在其宝座左侧调查可获得龙的最强武器皇帝之剑。踏上圆形装置下降至神的领域，女神ミリア的外表是个楚楚可怜的少女，当ミリア问龙是否原谅她的过错时，龙想到女神的累累罪恶；为了消除无端的恐惧而毁灭了鼎盛的龙族文明、为了支配世界驱使邪恶的黑龙族屠杀无辜…大声说出了：“不！”女神顿时恼羞成怒。回答问题的不同选择以及是否达成真-龙皇帝隐藏要素使女神在战斗中变化的状态有所差异，如果拒绝女神的请求并达成了真-龙皇帝时女神ミリア最终会以真实状态（五头邪龙）出现！而结尾也有所不同。
神的领域随着女神的失败而崩溃，众人从空中坠落时被及时赶来的有翼族人救回ウインディア。并肩作战的伙伴终于要分别了，将同伴一一送别后龙只身再度踏上孤独的冒险之旅。此时天边彤霞似锦、残阳如血，龙仿佛看到姐姐セィラ亲切的笑脸…