convert.exe命令转换文件格式后会不会影响硬盘数据

不会的，这是Window自带命令，除非遇到了断电之类情况，但转换很快的，一分钟也不用，一般是没问题的。比如转化D盘就输入Convert D: /FS:NTFS 使用命令之后它可能提示你系统正在使用这个盘，要下次开机再转化。

要注意的是，这个命令不可逆，因为转化为NTFS会有一些特殊的数据，如果非要转化回去可以用分区魔术师，但可能会出现一些乱码。如果只是像你说的那样正向的转化是不会丢失数据的。