生化奇兵:无限游戏设置
美国政府的初衷是将哥伦比亚视为和平与善意的象征，但它的存在对所有国家都是一种持续的威胁。
哥伦比亚的居民也有这种优越感。与此同时，他们建造这座城市的父亲被当作神来崇拜，所以人们产生了虔诚的宗教信仰，城市管理者也向居民灌输了一种极端的美国民族主义。
然而在游戏开始的时候，哥伦比亚已经消失了好几年，据说是因为一场残酷的国际事件。事实上，哥伦比亚不是一个简单的城市，而是一艘拥有大量重型武器的空中战舰。然而，哥伦比亚领导人和美国政府之间出现了分裂，结果整个城市消失在云端。在过去的几年里，没有人知道它的位置——直到一位顾客发现了一个名叫布克·德威特的人。
布克来到哥伦比亚时，可以听到远处的爆炸声和枪声，到处张贴着带有强烈的极端民族主义风格的海报，甚至有些建筑正在从天而降...显然，云上的城市因为战争而分崩离析。哥伦比亚的居民分为两股势力，一股是统治城市的政府，另一股是地下抵抗组织Vox Populi，试图消除弥漫在整个城市的民族主义和排外情绪。为了达到这个目的，他们甚至不惜炸毁哥伦比亚。布克发现伊丽莎白是争论的焦点。
伊丽莎白走到哪里，冲突似乎就跟到哪里。布克逐渐了解到这座城市有一个预言:伊丽莎白将决定这座城市的命运。出于各自的目的，政府和人民之声都想把伊丽莎白据为己有。1912年，伯克·德维特被莲花双胞胎带到缅因州外一个岛上的灯塔。楼里有一个火箭发射井，他的任务是“找到女孩，抵消债务”。
伯克起初在哥伦比亚并不被人注意，直到发现了烙在他手上的字母“AD”，以及假牧师标志，康斯托克预言假牧师会误导羔羊(伊丽莎白)，给哥伦比亚带来毁灭。成为通缉犯的伯克一路来到关押伊丽莎白的纪念塔，沿途发现其底座有一个大型虹吸装置。伊丽莎白获救后，鸣禽攻击并毁坏了雕像的一部分。伯克和伊丽莎白逃脱了。伯克以乘坐飞艇去伊丽莎白向往的巴黎为由，搬到了码头。当伯克将飞艇的目的地指向纽约，准备运送伊丽莎白时，她用扳手将他击昏。当他醒来时，他发现飞艇已经被黛西·费泽·阿来和那个人的声音控制了。费泽·洛伊要求伯克在哥伦比亚贫民窟找到武器，然后归还飞艇。
再次见到伊丽莎白后，伯克冒险深入城市。当伊丽莎白使用她的能力操纵裂缝时，她对操纵伯克和其他人的后果感到不安。一个裂痕把他们带到了另一个世界，在那里伯克已经成为人民之声事业的殉道者，这导致了人民之声与创始人的斗争。这个世界的费泽·洛伊认为伯克伤害了这个世界的牺牲者伯克，威胁了人民的声音事业，所以她要求她的军队追捕他。当费泽·洛伊准备处决一名创始人的孩子时，伊莉莎白被迫杀死了费泽·洛伊。
当他们准备乘飞艇离开哥伦比亚时，遭到鸣禽袭击，落回哥伦比亚。当他们继续逃亡时，他们揭露了这座城市背后的阴谋。康斯托克收养了伊丽莎白来培养这个城市的领袖。他让莲花双胞胎制作虹吸装置来制服伊丽莎白。他密谋杀害他的妻子以掩盖真相，并将其归咎于人民的声音。伊丽莎白被鸣鸟带回了康斯托克宫，伯克跟着她到了那里，却被传送到了未来。老伊丽莎白因为伯克的抢救失败，遭受了几十年的折磨和洗脑。她继承了康斯托克的事业，向下面的世界发起了战争。她向伯克展示鸣禽在过去总是会阻止他的救援，并恳求伯克以她提供的方式控制鸣禽，以防止这种情况在未来发生。
伯克回到现实世界，继续营救伊丽莎白，并跟随科姆斯托克的飞艇。康斯托克要求伯克向伊丽莎白解释她的过去，为什么伊丽莎白少了一根手指。伯克被激怒，淹死了康斯托克。他否认他知道伊丽莎白手指的任何事情，但她声称他知道，但他不记得了。伯克决定摧毁虹吸装置，这样伊丽莎白就可以得到她所有的能力，知道真相。他控制了鸣禽，击退了人民之声的进攻，让鸣禽破坏了虹吸装置。当设备被摧毁时，鸣鸟试图攻击伯克。伊丽莎白及时打开了一条裂缝，把他们运送到了水下城市。伯克和伊丽莎白在大楼里很安全，但鸣鸟被困在外面，被巨大的水压压死。
伊丽莎白带伯克去了世界之巅和灯塔。他们通过一道门来到了超越时空的地方，那里有无数的灯塔和其他版本的伊丽莎白和伯克。伊丽莎白解释说，他们是无数个世界的成员，这些世界既相似，又因为不同的选择而大不相同。她展示了1893，10年10月8日，罗伯特·卢特斯代表康普斯托克接近伯克，要求他“给我们女孩，抹去债务”，指的是刻在伯克女儿安娜·德维特身上的“广告”。伯克勉强同意卖掉安娜，但很快就改变了主意。他去阻止科姆斯托克通过裂缝逃跑，但为时已晚，裂缝闭合时孩子的手指被切掉了。康斯托克后来提议安娜作为他的女儿伊丽莎白。因为断指，伊丽莎白同时存在于两个世界，这让她可以随意制造和打开裂缝。后来，罗伯特对伊丽莎白的待遇和康斯托克的背叛感到愤怒，并说服罗莎琳帮助他将伯克带到哥伦比亚存在的世界。
伊丽莎白解释说，无论伯克如何对抗康斯托克，康斯托克至少在其中一个世界还活着；Lotus无数次尝试从不同的世界招募Burke来结束这个循环。打破这种循环的唯一方法是阻止康斯托克的诞生。伊丽莎白带着伯克去了他因伤膝河战役中犯下的罪行而受洗的地方。伯克在最后一刻拒绝受洗，却在另一个世界受洗，确立宗教，成为康斯托克。康斯托克，知道自己的本质是伯克，在接触到莲花的技术后失去了生殖能力，然后计划绑架安娜作为自己的哥伦比亚继承人。伯克和伊丽莎白加入了来自其他世界的伊丽莎白人，伯克允许他们淹死他，以防止他的选择导致康斯托克的诞生。最后，伊丽莎白一个个消失了，屏幕又切换回原来的黑色。
赛后制作人名单，伯克6月8日醒来1893，10。他叫着安娜的名字，在屏幕变黑之前打开了她的门。伊丽莎白:一个在哥伦比亚被囚禁了很久的女孩。她非常聪明。她大部分时间都在学习地理、医学、物理等学科，同时以密码学和开锁的形式获得许多实用技能。她有能力感知和操纵整个哥伦比亚的空间裂缝。她在被切掉的小指尖上戴着顶针，虽然不记得是怎么回事了。当她被拘留时，她受到鸣鸟的保护，鸣鸟是一种巨大的、类似机器鸟的生物，是她的朋友和监护人。
哥伦比亚的创造者扎卡里·康斯托克(Zachary Comstock)是游戏的主要反对者。康斯托克声称他从大天使那里得到了未来的幻象，成为了一名宗教狂热分子，他在哥伦比亚被尊称为“先知”。康斯托克声称伊丽莎白是他的女儿，由他已故的妻子奇迹般地生下，并且只在子宫里呆了七天，并称她为未来领导哥伦比亚的“羔羊”。他创造了一种宗教，把美国的开国元勋们当做宗教人物，与基督教混为一谈。同时，他对亚伯拉罕·林肯这样的人避之不及，认为他是“魔鬼”，导致美国误入歧途。在游戏中的一个地点，玩家会遇到一个类似邪教的组织，并将约翰·威尔克斯·布斯视为英雄。康斯托克为了保持自己的领先地位，个人崇拜他，把他的创作编织成神话，这也保护了他的秘密。在他的领导下，哥伦比亚已经成为种族主义和性别歧视思想的滋生地。少数民族遭到没收财产、非法拘留、酷刑、刑事劳动和未经指控的即决处决。尽管康斯托克认为这些罪行从未发生过，但他本人透露，他至少对三起谋杀案负责，并强力清洗了40名持不同政见者。
黛西·费泽·罗伊，“人民之声”的领导人。非裔美国人，她去了哥伦比亚开始新生活，在康斯托克的豪宅里做管家。当康斯托克为了保护伊莉莎白的生命而谋杀他的妻子时，他诬陷了费泽·洛伊，并假定“人民的声音”是人民的公敌，以进一步将哥伦比亚变成一个警察国家。这激起了费泽·洛伊对创始人的仇恨，开始承受人民的呼声，领导下层民众反抗康斯托克。尽管与创始人的不公正行为作斗争，黛西和人民之声并没有比创始人做得好多少。为了推翻康斯托克，他们在起义中极力屠杀平民，利用娃娃兵打心理战。
罗伯特·鲁特西(Robert Lutece)和罗莎琳德·鲁特西(Rosalind Lutece)是带领伯克前往哥伦比亚的两个神秘人物，并在他的旅行中多次出现。他们看起来几乎和异卵双胞胎一样，但后来发现他们是两个不同世界的同一个人，只是性别不同。罗莎琳根据康斯托克的意愿发明了让哥伦比亚免于破产的技术，并联系了罗伯特。他们想出了互相交流的方法，然后在不同的纬度之间旅行到他们想要的程度。在剧情中，康斯托克试图通过破坏莲花双胞胎的装备来谋杀他们，以保护他的秘密，但最终他们进入了一种不稳定的状态，存在于时空的“无限可能”中，在无限的时空中永生。现在他们作为现实的代理人，试图在不直接操纵事物的情况下纠正不平衡。
无良商人耶利米·芬克(Jeremiah Fink)垄断了哥伦比亚的产业，通过观察破解获得了包括鸣禽在内的技术。芬克是康斯托克的主要支持者，使他能够利用较低层次的廉价劳动力，尽管他不同意康斯托克的宗教狂热。在哥伦比亚，他成了名人，并在全市做了大量宣传。
科尼利厄斯·斯莱特是与伯克并肩作战的战友，一起参加了伤膝河战役，跟随康斯托克，在义和团运动中摧毁了北京。当他发现康斯托克声称伯克和斯莱特的成就属于他时，他感到失望，然后反叛。