轩辕剑2中善神恶神究竟为什么联手

没有，起码我认为没有。因为轩辕剑二就根本没出现善神，只出现了恶神（巴蛇），而江如红的“师傅”火凤凰，则是巴蛇的手下，绑架江如红是因为忌惮手持假轩辕剑的江如红之父江长风（巴蛇并不知道江长风的剑是假的），火凤凰又给江如红下了咒，让他见到父亲就失去理智下杀手，江长风也确实险些遇害（古月圣，也就是天之痕里的古月仙人舍身救了江长风，自己身死，后被炼妖壶配合如来舍利救活，过程复杂，不赘述），刺杀事件后，何然一行很是愤慨，于是杀上火焰山（巴蛇的老巢）屠了巴蛇，巴蛇至死也没提善神为什么倒戈。巴蛇死后，何然马上就沦为了壶中仙计划中的棋子，为其找齐四圣器（视肉、雕像、金乌镜、月宫琴）打开昆仑仙境的通道。而游戏的结局就是何然借助轩辕剑的力量和女娲大神的帮助消灭了壶中仙，粉碎了其疯狂的计划（具体计划轩四有提到），也没再说善神倒戈的原因。