生化先锋的故事情节
主角完成任务后不久，FSA政府意识到像主角这样的生化药剂可能会对国家安全造成威胁，于是推出了所谓的仿生清洗政策:拆除那些退役士兵的生化部件。这一政策自然引起了很多经过生化改造的士兵的不满。因此，经过一系列的暴动、暗杀、审判和清洗，许多仿生士兵被投入监狱或被判死刑，剩下的流亡者组成了对FSA极度敌视的组织:bio regine，生化士兵联盟，这是一个在游戏开始就用核弹引爆城市的恐怖组织。
我们的主角内森·斯潘塞没有参加这个组织。在信天翁计划中获救的超级乔陷害了他，给了他一个暗杀任务。斯潘塞因为这次任务被判谋杀罪，被判死刑，关进了监狱。
我得先说说超级乔。他出现在许多早期的卡普空游戏中。原型来自于当时冷门的美国漫画:《G.I.Joe》这个名字，80后应该很熟悉。(在原著中，G.I.Joe是一个项目的名称，而不是一个单独的角色)，所以在这本书的开头，得知斯潘塞被他陷害入狱，是相当震惊的。另外，根据任务期间的交流，乔在消灭政策中的行为是尽力保护生化兵，忍辱负重维护生化兵的权益。
斯潘塞不喜欢FSA和乔，但乔说他知道斯潘塞失踪的妻子艾米丽的下落，说如果任务完成，他可以告诉他找到她的线索。另外，斯潘塞并不认同恐怖组织伤害无辜民众的行为，所以他接下了这个任务，开始潜入计划。
在这个过程中，乔所属组织TASC(Strategic Security Committee，战略安全委员会)的Armstrong将军指出，斯潘塞的任务是在一座被bioreign摧毁并占领的城市中找回一件物品，而这件物品的真实信息是高度机密的，连乔所在的位置都无法得知——最终，它似乎是一个能量核心，可以启动数千个秃鹫机器人(也就是游戏中提到的Project Vulture)。很明显，bioreign的人也在寻找这个东西，这也是他们运作的根本目的。
在任务中，内森遇到了他的前下属Mag，他也是一个生化人:她的改造部分是她的腿。因为政府的仿生清洗政策只能导致她再次坐在轮椅上，所以她加入了BioReign。另外，从Hack得到的信息来看，Mag应该一直暗恋着Nathan，她对可能因为Nathan的转变而离家出走的Emily非常不屑。——可惜这个角色最后死的一文不值，编剧真是...(除此之外，内森还在《战地之狼》游戏中遇到了原本属于TASC-汤姆的神秘狙击手)。
根据Hack的信息，Nathan的妻子当年留了一张纸条。虽然内森说这是伪造的，因为语气异常，但警方放弃了搜查，因为邻居说他们夫妻发生了激烈的争吵。此外，内森在被关押期间的视频中，曾拍到他在取出生化手臂后轻抚插槽，露出某种害相思病的花痴表情。........
到了最后阶段，内森终于得知，乔就是利用政府职务之便，秘密成立BioReign的幕后人物。他的目的其实是利用秃鹫计划武力夺权，所以他利用了被迫害的愤怒青年和生化人，还打算利用内森一早通过斯潘塞的任务暴露能量核的真实位置。
Boss，和他合作的生化人，从档案中可以知道他应该是信天翁计划中帝国的干部。他没有出现在原版FC里，而是出现在了重制版里，一个典型的武力至上的脑残兵。
乔也是生化改造计划的发起人之一。艾米莉在他的劝说下参与了实验，并在某种程度上成为了战场上左臂被手榴弹炸掉的斯潘塞生化改造的催化剂。这里没有陈述游戏，但是从乔的描述来看，“最像人类的机器其实是由人类制造的；生化成分需要和本体有很强的精神纽带。“艾米丽应该是被他们杀了，用她的脑细胞之类的东西变成了这个生化手臂的一部分。”
最终，愤怒的斯潘塞撞坏了乔的秃鹰，绝望地从天上掉了下来...字幕之后，我们再来听一遍开头略带忧郁的钢琴版主题曲，细细品味。......